В 1679 году в Вене разыгралась тяжелая эпидемия чумы, унесшая треть от 100-тысячного населения города. В память об избавлении от страшной болезни в 1693 году в центре Вены была воздвигнута Чумная колонна. Однако 1713 год принес новую волну чумы. В подземельях под собором св. Стефана погребено 11000 жертв страшной болезни.
В 16 Вена стала столичным городом империи Габсбургов. Здесь находилось сосредоточие придворной бюрократии.
С 18 века в Вене получили широкое развитие мануфактурные предприятия.
С 18 по начало 20 века Вена являлась одним из главных центров мировой культуры, прежде всего музыки. В 1781 году в Вене поселился великий Моцарт, который принадлежит, наряду с Бетховеном и Гайдном к самым значительным представителям Венской классической школы. Людовик Ван Бетховен поселился в Вене в 1792 году.
На первую половину 19 века приходится появление стиля бидермейер, основоположниками которого стали венские художники, композиторы и театральные деятели. На это время приходится прогресс в искусстве и культуре.
В 1805 и 1809 гг. в Вену входили войска Наполеона Бонапарта. В 1817 году в Вене был проведен Венский конгресс, который привел к существенным изменениям на политической карте Европы.
Во второй половине 19 века образование и наука продолжают процветать в Вене. Венская Академия наук и Венский университет пользовались мировой славой. В конце 19 века возник Венский сеценссион (объединение художников и архитекторов), в который вошли архитектор Отто Вагнер, художники Климт и Мозер и другие.
К началу 20 века Вена была одним из самых больших городов Европы. Население города составляло около 2 млн. человек. Однако с поражением Австро-Венгрии в первой мировой войне, Вена утратила прежнее влияние. Династия Габсбургов пала, в городе происходила политическая борьба между консерваторами и социалистами. В 1928 году в Вене произошли массовые беспорядки, унесшие жизни 89 человек.
В 1934 году произошло Февральское восстание, в результате к власти пришел режим австрофашизма.
В марте 1938 году в Вену вошли немецкие войска.
В апреле 1945 года Вена была занята советскими войсками. В результате англо-американских бомбежек и уличных боев городу был причинен значительный ущерб.
В 1945 году было заключено соглашение об управлении Веной. В результате город был разделен на советский, английский, американский и французский сектора. Войска союзных стран покинули Вену в 1955 году. С этого времени Австрия была объявлена нейтральной и независимой страной.
Во второй половине 20 века в Вена проводилась активная застройка, а также реконструкция исторического центра города. Городу удалось сохранить свое уникальное лицо, которое было создано непростой многовековой историей.